[cpstink]

По поводу тихой установки я ничего сказать не могу, так как у меня это решилось само собой через WSUS.
А вот по убрать программу из "установка и удаление программ" можно либо не создавая ветки реестра для программы, либо удаляя их в конце инсталляции из реестра (для этого хоть раз нужно поставить программу и посмотреть чего создаёт инсталлятор).