[Severny]

Не может (не считая вероятности, что вирус неизвестен антивирусам), если ты вставишь флешку заранее на выключенном, после загрузишь live-cd с антивирусом и проверишь.
Только нужно самому ничего с флешки не запустить, иначе может активизироваться файловый вирус и заразить исполняемые на hdd.
А втыкать флешку после загрузки live-cd и включения антивируса опаснее, т.к. сможет сработать автозапуск, а антивирусы на live-cd не имеют резидентной защиты, т.е. не распознают запуск вредоносного ПО. Там только сканеры.