в xorg.conf найдите блок InputDevice посвященный настройкам мыши и выложи сюда.
либо как вариант поменяй параметр Device на sysmouse.
должно получиться чтото вроде:
Код:

Section "InputDevice"
...
Option "Device" "/dev/sysmouse"
...
EndSection
p.s.
вместо точек естественно те параметры которые там уже есть