[mdn]

Ну совсем форматировать винт я бы не стал. Никчему это. Просто переименуй папки Windows, Program Files как нибудь, а после переуст-ки винды, если она будет нормально работать, снеси их.
По настройкам:
Оформление рабочего стола - ключ HKEY_CURRENT_USER\Control Panel\Appearance\Schemes
Настройки клавы (язык по умолчанию и способ перекл.) - ключ HKEY_USERS\.DEFAULT\keyboard layout
Курсор - ключ HKEY_USERS\.DEFAULT\Control Panel\Cursors
Звуковое сопровождение событий - ключ HKEY_USERS\.DEFAULT\AppEvents

Я вынес эти настройки в отдельный reg-файл и после переуст-ки возвращаю настройки двойным щелчком :-)

[Blast]

К сказанному Sobol`ем добавлю что не помешает, а даже поможет удаление файлов находящихся в корне диска...
И вот еще немного на тему как переустановить. (тут конечно немного лишнего, но и по сути вопроса есть)