Прежде всего - реестр живет в ОЗУ, а файлы - резервные копии отдельных частей реестра.
mb
system - резервная копия ветки HKLM\SYSTEM. Аппаратная часть описана в ветке HKLM\HARDWARE. Эта ветка вообще не имеет представления в виде файла.
Вот читайте
Inside registry о жизни реестра изнутри
