[shevgenius]

Shiirx, покажите ipconfig /all с обоих dns серверов и клиентов из разных офисов.

Проверьте у себя, на DNS-серверах и клиентах в настройках сетевой карты должны быть только IP-адреса ваших внутренних DNS-серверов.
DNS-провайдера для выхода в интернет прописывается в настройках роутера или в настройках DNS на вкладке "Сервер пересылки".
В каждом филиале адрес предпочтительного DNS-сервера должен быть IP-адресом DNS-сервера из того же филиала.

После изменения настроек на сетевой карте ipconfig /flushdns
Да и еще можете попробовать снять галочку с "Append parent suffixes of the primary DNS suffix" она же "Дописывать родительские суффиксы осн. DNS-суффикса"

Ping по IP ваших domen-1 и domen-2 проходит, внутри офиса из филиала? - здесь смотрите настройки брандмауэра, сетевое обнаружение, общий доступ к файлам и принтерам.

Подробнее можете посмотреть:
Контроллер домена 2008 R2
How the Client DNS Settings work to resolve DNS names или cache-страницы

Проще говоря

Код:

Офис1:
name: dns-office-1.company.com  - ваш днс из офис1
           ip: 192.168.0.1   - ваш днс из офис1
  dns-primary: 192.168.0.1   - ваш днс из офис1
dns-secondary: 192.168.128.1 - ваш днс из другого офис2

name: client-office1.company.com - ваш клиент из офиса1
           ip: 192.168.0.101 - ваш клиент из офис1
  dns-primary: 192.168.0.1   - ваш днс из офис1
dns-secondary: 192.168.128.1 - ваш днс из другого офис2


Офис2:
name: dns-office-2.company.com - ваш днс из офис2
           ip: 192.168.128.1   - ваш днс из офис2
  dns-primary: 192.168.128.1   - ваш днс из офис2
dns-secondary: 192.168.0.1     - ваш днс из другого офис1

name: client-office2.company.com - ваш клиент из офиса2
           ip: 192.168.128.101 - ваш клиент из офис2
  dns-primary: 192.168.128.1   - ваш днс из офис2
dns-secondary: 192.168.0.1     - ваш днс из другого офис1