[WindowsNT]

Так это работать не будет.

[pashka75]

Будет!
Вот как!
1. Запустить редактор реестра (Пуск->Выполнить: regedit).
2. Найти ветку реестра HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\SystemCertificates\My
4. Нужно экспортировать ветку KEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\SystemCertificates\My в reg файл!
Все заработало!
Ну а если через крипто про то так!
1. Запустить редактор реестра (Пуск->Выполнить: regedit).
2. Найти ветку реестра HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\ProfileList
3. Выбрать SID(имеет вид, например, S-1-5-21-1993962763-492894223-1202660629-6195), и посмотреть ProfileImagePath, в конце строки найдете имя пользователя, которому принадлежит этот SID.
4. Нужно экспортировать ветку HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Crypto Pro\Settings\USERS\SID_текущего_пользователя\Keys в reg файл.
Для 64-битных систем это HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\Crypto Pro\Settings\USERS\SID_текущего_пользователя\Keys
5. В reg меняете через автозамену SID_текущего_пользователя, в Вашем случае, старый на нового.
6. Запускаете reg файл, после этого все готово, но необходимо будет заново установить личные сертификаты для того что бы приязать сертификаты к контейнерам. Если не будет видно контейнеров, то неправильно указали SID_пользователя, т.к. контейнеры видны только под тем пользователем, под SID’ом которого они находятся!

[WindowsNT]

Толку от ваших потуг — чуть менее, чем ноль. Проверьте закрытые ключи, чтобы убедиться в этом.
И вообще, вам сюда: https://www.outsidethebox.ms/13148/ , пункт первый.