Значит, у вас явно битая таблица разделов на флешке. А система с неё, я так понимаю, грузится, да? Можно попробовать создать новую таблицу:
Код:

dd if=/dev/zero of=/dev/sda bs=2 seek=223 count=32
fdisk /dev/sda
Но есть риск потерять все данные. Впрочем, я сейчас проделал это - сам раздел оказался нетронутым и данные на нём тоже целые.