[misha2]

Да там вполне нормальный СМАРТ, за исключением показаний датчика ударных нагрузок.

[IgNat]

necrospunk, попробуйте Пуск -> Выполнить -> cmd -> chkdsk n: /x /b (n: - буква проверяемого раздела), для системного раздела согласиться на проверку после перезагрузки. Для других разделов перезагрузка не потребуется. Операции с данными ключами, равно как и с ключом /f, являются деструктивными!, некоторые данные могут быть утеряны! Рекомендуются сделать резервную копию важной информации на другой носитель! Отчёты из окна cmd/командной строки приведите в сообщении.

[necrospunk]

IgNat, сделал. Правда отчеты не успел прочитать. Результата не дало.

[IgNat]

necrospunk, проверьте целостность системных файлов:
Пуск -> Выполнить -> cmd -> sfc /scannow
Возможно, потребуется дистрибутив OS. По окончании процедуры восстановления, если есть ошибки, скопируйте отчёт из окна командной строки, приведите здесь.

[necrospunk]

Защита ресурсов Windows не обнаружила нарушений целостности.

[IgNat]

necrospunk, загрузитесь в режиме Восстановление системы, например с установочного DVD/USB, запустите Восстановление запуска.

[necrospunk]

Нет установочного DVD/USB. Образ винды на скрытом спец разделе.
Запустил Восстановление запуска. Там все хорошо. Ошибок нет.

[IgNat]

necrospunk, Пуск -> Выполнить -> msconfig -> Общие -> Диагностический запуск, результат?

[necrospunk]

После лого Win экран черный, несколько секунд, потом появилось окно ввода пароля. От ввода до загрузки раб стола прошло хорошо, быстро.

Я тут нашел нечто похожее: Долгая загрузка Windows 7
Может и у меня диск того?

[IgNat]

Может и у меня диск того? »

- что "того" И по SMART и по вашему утверждению:

Было несколько сотен со временем 50ms - это максимально. »

- всё в норме.
Учитывая же:

От ввода до загрузки раб стола прошло хорошо, быстро. »

- проблема системная. Удалите всё программы, установленные за несколько дней до возникновения проблемы.
Выполните рекомендации статьи: Использование средства проверки драйверов Windows