Долгий заход в папку обуславливается тем, что система автоматически сканирует файлы в открываемой папке на поиск даты последнего обновления файлов. Можно отключить параметр в реестре -
NTFSDisableLastAccessUpdate , и проверить скорость.
Ну и как вариант - старый добрый DOS'овский COPY и XCOPY.
