[DJ Mogarych]

zhecka, делается так:
1) В VirtualDub открывается файл, делается "сохранить WAV..."
2) Полученная аудиодорожка кодируется в CBR mp3.
3) В VirtualDub во вкладке "Видео" ставится Direct stream copy, а в "Аудио" выбирается полученный CBR mp3 файл (тоже в режиме Direct stream copy).
4) Нажимается F7, полученный файл сохраняется в нужное место, проверяется, и затем стирается старый файл с аудиодорожкой VBR.

Аудиодорожку лучше всего обрабатывать и сжимать вне VirtualDub-a, не будет проблем с синхронизацией.

Автоматизировать этот процесс вряд ли получится — слишком специфические операции. Может быть, получится каким-нибудь демультиплексором извлечь пакетно аудиодорожки из всех файлов, но обратно их зашивать придётся всё равно руками.

А зачем нужно перекодировать VBR в CBR? Стационарный плеер не умеет читать VBR mp3?