У меня было так. Секунд через 30-90 после загрузки Винды уходили в синий экран и на перезагрузку. Так до бесконечности. Подумал, что вирусы, начал гонять их при помощи загрузочного CD с Линуксом Dr.Web LifeOnCD. Машина на перезагрузку не шла, вирусов - нет. Проверил модули памяти - ОК, загрузил Винды с другого жесткого диска - перезагрузка

В подозреваемых был блок питания, но второго под рукой не оказалось. Залез с зеркалом взглянуть на материнскую плату, и в результате оказалось, что от старости (ей уже лет 6) на ней вздулись конденсаторы. На блоке питания тоже 2 вздулось...
Процессор информировал о плохом питании Винды, и они останавливали машину с ошибкой 0x0000009C_MACHINE_CHECK_EXCEPTION (0х00000000, 0х8054DA70, 0xB2000000, 0x1040080F) А Линукс инфу от процессора не воспринимал, поэтому под ним всё работало.