Траффик репликации - копеечный, особенно при таком количестве пользователей. Зубанов говорит на 64 кбит\с можно до 100 тыс объектов безболезненно содержать. А вот при потере домена что делать?
Мой совет - сайты. Упал филиал - приехали подняли заново контроллер и спите спокойно дальше.
Федор Зубанов "Active Directory: Подход профессионала"