"Красные крестики" это и есть последствия падения твоего HDD, головка бады на винте делать не может. Винда работает потому-что нужные ей файлы не находятся в районе бядов. На выбор тебе несколько вариантов решения твоей проблемы:
1) Поробуй пройтись с MHDD ещё раз, только включи функцию "Remap"
2) Проверь полностью диск и обрати внимание с какого и по какой сектор идут бяды, т.е. если они идут на протяжении 3-7 гигов и может и меньше, просто разбей жёсткий диск, на разделы так чтобы участок с бядами был не тронут.
3) Возьми статистику бядов, и проверь через неделю другую ещё раз, если ох количество увеличится, то советую искать другой винт (благо они щас стоят дёшево) и сливать на него всю свою информацию... часть которой возможно не скопируется из-за повреждённых секторов.
ps если интересно можеш почитать про бяды
тут.