так я по-старинке: less/var/log/messages в-основном, ну и другие логи + система daily- weekly- monthly по крону настроена во Free и без меня очень разумно
следить за машиной все время - я бы не выдержала
тем более не за одной. Если хочется делать апплет - так флаг в руки - все равно он будет делать все тот же less/var/log/messages Ну покажет красиво, что приятно.
По исследованию трафика и логов доступа - поищи, по-моему тут где-то обсуждались биллинговые системы. (насколько я понимаю, в твоем случае это не очень актуально?)