Так это опция описывает индикацию, а для того, что-бы было две раскладки надо менять другую опцию
Код:
Option "XkbLayout" "us,ru"
Option "XkbVariant" ",winkeys"
Option "XkbOptions" "grp:ctrl_shift_toggle"
Option "XkbLayout" "us,ru" - американская и русская раскладка
Option "XkbVariant" ",winkeys" - у русской расладки Win разновидность
Option "grp:alt_shift_togglel" - смена раскладки ALT+Shift
Option "XkbOptions" "grp:ctrl_shift_toggle,grp_led:scroll" - смена раскладки CRTL+Shift, индикация на Scroll Lock