Может стоит попробовать Partition manager? Я когда устанавливал сначала партишном диск переразбил, а уж потом стал фрю ставить.
Там наверняк тот кусок, который исчез обозначен как unformatted. Теоретически поправить можно. А fdisk мне кажется лучше выкинуть на свалку