Вот те самые настройки операций с файлами. Стоял второй вариант, сейчас поставил первый, вроде бы всё нормализовалось, опять же повторяюсь, именно через ТК такое было.
Только вот подтвердил бы кто, действительно ли такое возможно из-за способа копирования без кэша?