Дело в том что win 2k использует схему active Directy отличную от nt - доменов. поэтому если надо дружить с win 2k без глюков то ставь samba 3.0.
подробности на
www.docs.altlinux.ru/admin/
Но я тоже считаю что в Оконной сетке ставить самбу контроллером - это гемор.
бай, пингвинз