1) в самом skype есть адаптивная громкость микрофона (см. настройки)
2) звуковая карта может иметь аналогичные настройки
3) гарнитура/микрофон может иметь аналогичный функционал
Функция в целом полезная, но включать её надо где-то в одном месте, иначе результат может быть непредсказуем - примерно как в данном случае
Ну и не везде она одинаково хорошо реализована.
