А что под этим подразумевается? Это схема, показывающая процессы организации/выполнения работы или как? Если первое, то есть специализированные программы, предназначенные как раз для построения схем взаимосвязи процессов (ARIS/IDEF) - ARIS Toolset/BPWin (по IDEF схемы делает довольно много софта, даже в Visio есть соответствующие стенселы).
Ты бы объяснил, какого типа схему рисовать собираешься...