[RasskazovBSD]

Для детального прояснения:
1. Перейдите в однопользовательский режим (при этом пользователи выкидываются из системы и прекращается потдержка сети) shutdown затем используйте shutdown -p now. Результат в топик.
2. При использовании команды перезагрузки (halt, reboot или shutdown -r now) вы доходите до тестирования БИОСом важего железа?

Если линух тушит, то ACPI работает. Как вариант, можно грешить на опцию в ядре, на некорректное завершение программой init запущенных процессов либо дело в скрипте /etc/rc.shutdown.