1) удаляй, эта папка осталось для того, чтобы ты мог анинсталлить 98лайт и вернуться к обычной 98 винде. (как я понял, ты поставил оболочку от 95 винды?)
2) про папку виндоза написано в любом ФАКе, и перечислять тут все то, что можно в ней убить, я не буду