shekspir
Лично я у себя в 98й пользовался для этого старым добрым
RegCleaner'ом.
У него вторая вкладка в главном окне отвечает за автозагрузку, на ней сведена в одно целое инфа и из Пуск/Автозагрузка, и из вышеупомянутых ключей, что особенно приятно, учитывая то, что прописывают себя в автозагрузку разные программы постоянно, часто без спросу, а просматривать каждый раз все места по очереди - увольте-с.
Кроме того, если убираешь что-нибудь лишнее - можно восстановить из резервной копии.
Да и графический интерфейс, как по мне, удобнее, чем по реестру и папкам лазить