Заглянул в ''редактор настроек Wundows'' и ''Настройки Виндовоза'' - удаляют записи из списка (не трогая программ), да наверное, вообще любой твикер это сможет (эти просто инсталировать не требуется). Я ими выкидал те программы, которые деинсталировать не собираюсь вообще.
А вот в реестр руками (не зная) лучше не лазить...