[DJ Mogarych]

Итак:

я захватываю пермьерой с камеры без сжатия в uncompressed avi

У Вас, наверное, места на винчестерах куры не клюют, завидую. Можно захватывать видео и несжатым, но смысла в этом нет — уж чересчур много места кушает.
Определимся. Сначала видео сжимается при захвате (промежуточное сжатие), а затем при выводе готового фильма (конечное сжатие).
Лучше всего при захвате жать в HuffYUV (без потерь) или в Pegasys MotionJPEG (с качеством 19, потери пренебрежительно малы). В x.264 и подобные "модные" форматы жать нет никакого резона.
Во-первых, как кодек для промежуточного сжатия он не подходит, т. к. кодирует кадры не каждый по отдельности, как HuffYUV и MotionJPEG, а подобно MPEG-форматам, где есть основной кадр и подчинённые (в подчинённых содержатся только отличия от ключевого), так что для последующего монтажа такой расклад не подходит.
Во-вторых, конечное видео должно соответствовать тому, что имеем на входе. Если это обычная mini-DV камера, тогда за глаза хватит формата DVD (MPEG-2) как конечного продукта. То, что обычный DV будет закодирован в x.264, качества ему это не добавит, а проблем с совместимостью добавит точно.
Да, увлёкшись, совсем забыл об одном. Вы же захватываете с камеры, тогда вопросов вообще быть не может — захватываться будет в формат DV в любой видеомонтажной программе. Он тоже прекрасно подходит в качестве промежуточного формата, для последующего монтажа. Кстати, для захвата можно использовать и Movie Maker 2, который встроен в Windows XP, а можно маленькую программку WinDV. По моему скромному мнению, Премьер — неудобная и неочевидная программа. Я исторически пользуюсь Pinnacle Studio, сейчас 10-й версией. Есть и другие, также более удобные, чем Премьер.

1. Экспортирую видео после захвата в VirtualDub чтобы перекодировать. В итоге после кодирования в сжатом файле появляются полосы когда камера быстро движется. когда кодируешь прогой в mpeg то полос нет.. как от них избавится?

"Полосы" на мониторе появляются оттого, что на телевизоре и на мониторе разные способы вывода изображения на экран. Телевизор выводит сначала все нечётные строки, а потом все чётные (или наоборот, могу ошибаться), т. е. изображение на телевизоре делится на полукадры, а монитор выводит все строки последовательно. DVD-плееры на компьютере делают деинтерлейс автоматически, поэтому "расчёски" не видно, а VirtualDub выводит видео как есть, поэтому расчёску видно.
Избавляться от "эффекта расчёски" (интерлейса) не нужно, если конечный результат будет выводиться на DVD. Если конечный результат будет в файле avi (DivX и иже с ним), тогда можно вообще ограничиться использованием VirtualDub-a, сделав деинтерлейс фильтром Asvzzz deinterlace, и затем закодировав в любой кодек. Лучше деинтерлейсера, чем Asvzzz, я не встречал. Он автоматически определяет порядок полей, если они перепутаны, и свободен от гало-эффекта, и у него нет кучи разных непонятных настроек. Поделки MSU лично у меня никогда не работали нормально, а те, которые работали — ничего хорошего не выдавали, хотя понаписано о них, что прямо-таки панацея.

В общем, если видео хорошо снято и не требует особого вмешательства, то из видеомонтажной программы вообще никуда выходить не надо — там можно и захватить, и нарезать-сделать меню-наложить переходы/эффекты, и вывести готовый фильм на диск. Если видео требует какой-то коррекции — добро пожаловать в VirtualDub и обрабатывать там, потом пережимать в HuffYUV или MotionJPEG, открывать в видеомонтажной программе и доводить дело до конца.

Вот отличная статья на iXBT, освещающая многие вопросы.

2.какой кодек выбрать для кодирования?

Если кодировка ведётся в mpeg-4, то Xvid, но лучшим на сегодня способом кодирования конечного результата является DVD. И меню есть для навигации, и проиграть можно везде, и поддерживаться будет ещё очень долго.