Вариант для CMD (имя архива совпадает с именем исходного каталога):
Код:

@echo off
SET SOURCE=C:\SRC
SET DESTIN=D:\DST
SET RARCMD=C:\PROGRA~1\WINRAR\RAR A -M5 -R
CD /D %SOURCE%
for /f "tokens=* delims=" %%i in ('DIR /A:D /B %SOURCE%') do IF NOT EXIST %DESTIN%\%%i.rar %RARCMD% %DESTIN%\%%i.rar %%i\*.*