Я вот в теме давал
bat-скрипта для автоматического сохранения\восстановления сохраненных игр СТАЛКЕРа
как оказалось при установке первого же МОДа - все намного проще

В корневой папке Сталкера есть файл
fsgame.ltx. Нам нужна его первая строка, по умолчанию имеющая вид
Код:

$app_data_root$=true|false|C:\|Documents and Settings\All Users\Документы\STALKER-SHOC\
Ничего не напоминает? Верно, это и есть путь, по которому игра
какого-то ... сохраняет свои настройки и сохранения игрока. Достаточно прописать здесь путь, который вам больше нравится и - ву-а-ля).
Меня устроил вариант
Код:

$app_data_root$=true|false|..\save\
при этом игра создает папку Save в папке, куда она была установлена.
ЗЫ: не забудьте после изменения данной строки перенести предыдущие настройки и сохраненки в новосозданный каталог.
Удачи)