[vasketsov]

В реестре, насколько я знаю, такой настройки нет.
Проги сторонние - есть, прежде всего плагины к ИЕ.

Открытие попапа для броузера равносильно открытию документа в новом окне, ему совершенно нет разницы, потому механизмы, которые должны отслеживать такие попапы, очень часто ошибаются. Например, Naviscope 8.70 на NT4+SP6a+(IE5.5. Opera 5.12. NN4.75) с запрещенными попапами вообще не давал открывать страницы в новом окне.