Fixmbr в данном случае не подходит. Недавно я как раз на этом обжёгся. И раз необходимо пользоваться Win98, необходимо загрузиться с системной дискеты (компакта) Win98 (Me) и выполнить
Загрузочный сектор винчестера, а его нужно оставить единственны, при этом перепишется. Таблица разделов же затронута не будет. И активным его придётся сделать - дисковым редактором или той же самой командой fdisk.
Но коррида на этом ещё не заканчивается...