[AlexB17]

Есть много вариантов - смотря чем будете перегонять, потому как без пересжатия никак не обойтись (можно конечно втроенными средствами ffdshow - но это сложно настраивается и на каждой машине индивидуально). Если скажем будете использовать virtual dub то для него есть несколько фильтров logo remover - некоторые делают очень качественно, оставляя вместо лого еле заметное мутное пятнышко. Для avisynth есть плагин Xlogo.