На самом деле, тот же троян можно было вначале попробовать поискать руками. Просто в автозагрузке. А наилучший выход - загрузка под "диском спасени". Что-то типа аварийного диска из комплекта KAV/KIS 6.0 Т.е. загрузиться под чистой системой и проверяться.
А что вирус успел натворить - посмотри какой вирус найден и далее в вирусную энциклопедию.