[Razard]

Кроме HKLM\SYSTEM\CurrentControlSet\Control WaitToKill есть еще в HKCU\ControlPanel\Desktop параметры HungAppTimeout и WaitToKillAppTimeout. Их тоже нужно изменить на 50-80% в зависимости от мощности машины. Еще - AutoEndTasks - автоматическое завершение программы без потверждения - установи в "1". Это касается завершения программ в SystemTray (они почти все не службы). Не стоит сильно уменьшать все подобные параметры в реестре - это может нарушить стабильность системы при выходе (не успевает сохранять данные). Подбирать надо индивидуально.
Кроме всего прочего - поубивать все ненужные службы (что не надо - в описании и зависимостях).
В нете очень много инфы по настройке системы. Ищи по поиску. Будешь удивлен. Если нуна - дам ссылки.