Вполне возможно, что в это время начинает работать S.M.A.R.T.
технология жёсткого диска, т.е. он запускает самотестирование
во время простоя: проверяет подозрительные сектора на
чтение и если сектор не читается - автоматом переназначает
на свободный; хотя это только предположение
.