http://www.sysinternals.com/files/NTFILMON.ZIP
посмотри кто шо куда пишет
и очисти windows\prefetch\
может быть сильно фрагментирован pagefile да и весь диск
и возможно поможет отключение службы индексирования хотя последнюю лучше не трогать
а где ты брал BootVis