1) А нужно ли делать слепок? Я могу и ошибаться, но помоему если произошла програмная ошибка и сброс биоса по дефолту не помог, то прямая дорога в сервиз-центр, как если бы физический сбой.
2) Восстановить файлы можно прогами которые я привел ниже, а восстановить даже удаленый раздел можно с помощью Acronis Disk Director или ей подобными. (если звезды будут на твоей стороне)
3) Вообще-то у каждого производителя есть своя прога для низкоуровнего форматирования. Посмотри на оф.сайтах. Прогу "на все случае жизни" я еще не видел.
4) Как правило восстанавливается по копии. Частенько могут помоч утилиты scandisk и chkdsk.
5) Для XP скопируй папку C:\WINDOWS\system32\config. Для 98 скопируй файлы SYSTEM.DAT и USER.DAT.
6) Скопируй оригинал из дистрибутива, а лучше запусти установку в
режиме переустановки
7) Acronis Disk Director; EasyRecovery Professional; R-Studio; GetData Back. Можешь начать с этих.