[vampik]

Если "неудобное" приложение - msi, то подправить инсталлятор и запаковать в 7-zip SFX, если Inno Setup - подправить и запаковать обратно в Inno либо NSIS, в других случаях перепаковываю в NSIS. В особо тяжелых случаях (Фотошоп, Др.Веб,Daemon Tools) - AutoIT скрипт (причем даже если есть готовый, предпочитаю писать свой) и запаковать все получившееся хозяйство в 7-zip SFX.