KDE в топку.
Испоьзую Гном. Отчасти из-за того, что терпеть не могу konqueror, до боли напоминающий проводник, а nautilus там (в KDE), разумеется, поддерживается коряво. Да и софт изначальный устраивает больше. + темы и т.д. Из KDE приложений использую только SIM.
Дело вкуса.