[MuIIIeHb]

как отформатировать диск

При установке будет предложено на какой из дисков ставить систему и что с ним делать (форматировать в какую файловую систему и как (быстро, полное) или не форматировать).

есть ли возможность оставить некоторые программы

Есть, если эти программы не требуют прописывания в реестре (на самом деле их не так и много). Для этого программы с дика C:\ (если система стояла на нём) надо переместить\скопировать на другой, чтобы их не затёрло.

какие установки делать в BIOSе

В биосе надо выставит First boot Device (возможны вариации, н/р Premium Device) в положение CD.

есть ли у меня шанс, что система будет работать стабильно?

Бывают и неудачные случаи, но редко. Тогда просто заново поставить.

Трус не играет в хоккей. (песня)