Commandant
В msconfig - автозагрузка, наиболее прожорлив Msoffice (панель). Вообще в первую очередь нужно смотреть там по расположению в Common Startup (собственно и есть загрузка при запуске). Возможно есть такие программы, которые можно запускать по собственному желанию, когда это нужно.
Об их автозапуске свидетельствует наличие соответствующих значков возле языковой панели.
Можно воспользоваться, например, программой BootVis-Tool, взять по этой ссылке
http://www.filespace.ru/file?1601, и записать весь цикл загрузки и посмотреть что к чему. В этом плане программка достаточно наглядная. С ее же помощью можно автоматически оптимизировать загрузку системы.