[VseDoFeNi]

die_klaster
Самое простое, что приходит на ум, это запустить по очереди компоненты .Net.
DOTNETFX.EXE /Q
NDPSP.EXE /Q
LANGPACK.EXE /Q

Если хочешь, чтобы отработал Setup.exe читай, как создать unattended.ini для .Net.
А вообще возьми перепакованный и не занимайся ерундой