Я, конечно, минималист, но не настолько
чтобы править хедеры (можно вообще свой stub подсунуть), че ликовщик сделал - то и оставил. А секции и так на 512 байт, так что размер конечного exe-ника не уменьшится. Архив - да поменьше будет. Только в msistub можно совместить код и данные в одной секции - уменьшится на 512 байт, из-за строки "msiexec.exe /i %s". Если нужны исходники - в PM.