А какой профиль используется при кодировании звука? Если LC-AAC (low complexity), то поможет
aacgain. С HE-AAC (high efficiency) aacgain не работает. На думе пишут, что "Audio gain adjustment" (я так понимаю это и есть возможность задавать уровень громкости) уже запланирован в следующих версиях Nero Recode. Будем надеятся, что так оно и есть.