многие при создании AVI отклоняются от стандарта, самый простой, быстрый и надежный способ это пересохранить фильм в матрёшку, но я рекомендую для начала поставить другой сплиттер,
http://haali.cs.msu.ru/mkv/ вот здесь можно разом качнуть три сплиттера, для MKV, mp4 и AVI, возможно поможет, весят немного.