А если в значении есть символ "процент"?
Например:
Код:

reg add "HKEY_CLASSES_ROOT\*\shell\Открыть в Sublime Text\command" /ve /t "REG_SZ" /d "C:\Program Files\Sublime Text\sublime_text.exe "%1"" /f
Чтобы в значении осталось:
Код:

C:\Program Files\Sublime Text\sublime_text.exe "%1"