Извлеките аудиодорожку из видео целиком, а потом прикладывайте к другому видео.
Не пользуйтесь VirtualDub - его время прошло лет 15 назад, возьмите любую видеомонтажку, их полно, в т. ч. бесплатных.
Можно добавить аудиодорожку целиком и в монтажке уже отрезать/растянуть как нужно.
Как конкретно сделать эту синхронизацию - вряд ли кто-то подскажет.
Вот пример, как синхронизировать аудио с видео в бесплатной монтажке Shotcut:
https://www.youtube.com/watch?v=NXq-XFIDloA