ну как всегда у майков - просто не бывает.
оказывается, что в файле LayoutModification.json после его создания, нужно самому менять "pinnedList" на "primaryOEMPins" - тогда работает.
пример
Код:

{"primaryOEMPins":[
{"desktopAppId":"Microsoft.Windows.AdministrativeTools"},
{"desktopAppLink":"%systemroot%\\System32\\calc1.exe"}
]}
это только добавит свои ярлыки, то что уже есть в пуске - останется.