Понятно, разделяй и властвуй! Не проблема, вместо чека иметь три radioButton. Хотя на оффсайте JAVA, есть раздельные автономные версии.
У меня вопрос? Где вы считаете должна находится, по умолчанию, папка с приложениями "Software", в папке программы или в корне диска. Вопрос не праздный и дело не в кусе, так как, нужно правильно определить источник, при переносе программы на флешь или работы с сервера и лучше иметь сразу правильный, приоритетный поиск, а не нашел, уже искать далее.