Я бы на твоем месте лучше линуховый загрузчик настроил. Прописать несколько строчек в /etc/lilo.conf (если у тебя lilo), затем lilo под рутом и все бы пучком было. Затем для подобной операции можно было бы просто lilo запустить и все. Если хочешь сделать загрузку и linux через виндовый загрузчик - почитай FAQ на
www.linux.org.ru там подробно описано как это сделать, честно говоря не проще.