[K.A.V.]

Как создать MUI_PAGE_DIRECTORY custom? »

Справочник по NSIS => Описания плагинов => nsDialogs: Создаем собственные страницы инсталлятора

И как задать разные InstallDir для обычной и портативной версий? »

InstallDir можно переназначить в любой момент назначением переменной $INSTDIR путь нужного каталога, меняйте значение этой переменной в том участке кода, где пользователь делает выбор: обычная или портативная